ปัจจุบันผู้บริโภคมีแนวโน้มการบริโภคสินค้าเกษตรที่มีความปลอดภัยเพิ่มมากขึ้น แต่พบว่าเกษตรกรมีการใช้สารเคมีในการควบคุมโรคพืชที่มากเกินความจำเป็น ซึ่งส่งผลกระทบต่อสุขอนามัยของเกษตรกรและผู้บริโภค การควบคุมโรคพืชโดยชีววิธี (Biological control) เป็นวิธีหนึ่งที่ยอมรับว่าใช้ได้ผลดี โดยเฉพาะการใช้จุลินทรีย์ปฏิปักษ์ (Antagonist) เป็นทางเลือกหนึ่งที่สามารถลดการใช้สารเคมีอันตรายในการควบคุมโรคพืช  ทีมวิจัยจุลินทรีย์ได้คัดแยกเชื้อราไตรโคเดอร์มาจากตัวอย่างดินรอบรากพืช และยังได้พัฒนาต่อยอดเชื้อแบคทีเรีย Bacillus subtilis 9131B87 ที่มีคุณสมบัติในการผลิตเอนไซม์เซลลูเลส นำมาทดสอบประสิทธิภาพในการยับยั้งและควบคุมเชื้อสาเหตุโรคพืช โดยเฉพาะเชื้อราสาเหตุโรครากเน่าโคนเน่าในพืชเศรษฐกิจ อาทิ เช่น โรคต้นเน่าข้าวโพด โรครากเน่าโคนเน่าทุเรียน โรครากเน่าโคนเน่าในพริก โดยพบว่าเชื้อราไตรโคเดอร์มาสายพันธุ์ของบริษัท Trichoderma asperellum TCP2 และ Bacillus subtilis B87 มีประสิทธิภาพยับยั้งเชื้อราสาเหตุโรคต้นเน่าและรากเน่าโคนเน่าได้มากกว่า 60% โดยสามารถประยุกต์ใช้จุลินทรีย์ปฏิปักษ์ในรูปแบบผสมปุ๋ยอินทรีย์ (Probiotic organic fertilizer) หรือใช้ในรูปแบบหัวเชื้อเข้มข้น